Nature:全新化学物质机制,相分离驱动异常染色质成环,促进癌症发展

2021-11-15 04:55 来源:六盘水妇科医院

胃癌的的发展与靶向抗原质内在无序区具体来说(IDR)的遗传功用质持续性密切就其。各种抗原质(包括mRNA突变、丝氨酸调节剂和RNA混合抗原)里的IDR通过液体-液体交叉(LLPS)呈现出汇聚功用,受到影响从细胞膜器呈现出和刺激空腹到遗传功用质mRNA的无数生功用处理过程。

所谓的液体-液体交叉(LLPS)是所指融合两个不就其遗传功用质突变的处理过程。该处理过程频发在细胞膜核内,并需要呈现出具有各种功用理特连续性的具体来说,这些具体来说可以有助于胃癌,例如急连续性胃癌的频发的发展。在急连续性胃癌里,核酸抗原(NUP98或NUP214)的反复DNA易位诱发了一种持续性融合体,它常常保留核酸抗原 IDR——组氨酸和甘氨酸肽键(FG)的串联高度集中多次重复数列。然而,IDR如何导致遗传功用质错误催化反应和频发尚不清楚。

2021年6月初23日,北卡罗莱纳私立大学惠顿分校 Gang Greg Wang 一个团队等 Nature 发表了题为:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的研究者论文。

该研究者显然交叉是胃癌呈现出的驱动诱因,胃癌通过交叉获得突变以建起致癌mRNA突变汇聚功用,这同时加强了它们的遗传功用质组靶向连续性并在转化处理过程里抑制持续性一维丝氨酸骨架的呈现出。该研究者是最早将交叉与胃癌呈现出联络起来的研究者之一。因为在其他恶连续性里观察到了类似的遗传功用质融合,文章里概述的必要也可以解释其他多种类型的胃癌。

NUP98–HOXA9包括两个抗原质基序和一个混合数列。为了研究者NUP98-IDR在胃癌频发里的依赖性,研究者一个团队主要可用敲除了混合数列的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。

他们发掘出,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种用于破坏常与-交叉汇聚体的化学功用质)处理敏感。纯化的NUP98-IDR(N-IDR)抗原在体外呈现出液体体汇聚功用。

为了进一步分析报告FG多次重复数列对汇聚功用呈现出的含量忽视连续性和多价连续性的重要连续性,研究者一个团队合成了包括不同为数FG多次重复数列的重组N-IDR抗原质。他们发掘出N-IDR包括38个或36个FG以含量忽视连续性的方法多次重复呈现出的液体滴,那些包括27个或11个FG的却不能开展交叉。表明NUP98–HOXA9里的IDR以价忽视和含量忽视的方法建起LLPS。

NUP98–HOXA9通过互补骨架具体来说与DNA混合,导致胃癌频发处理过程里的遗传功用质失调。几周,研究者一个团队通过丝氨酸免疫沉淀和小分子测序来分析报告IDR特异性的交叉对NUP98–HOXA9丝氨酸靶向连续性的受到影响。

结果清高示, N-IDRWT/A9具有清高着加强的遗传功用质组占有率,而与无监理聚类下定义的平均值亚类也就是说。此外,周长而人口稠密的;也加强子样峰是N-IDRWT/A9所独有的,并且在发育期和胃癌就其遗传功用质富集。

为了进一步分析报告IDR抑制的LLPS在嵌合体丝氨酸靶向里的依赖性,他们利用了遗传学和药理学的原理,显然IDR特异性的LLPS在加强嵌合mRNA突变靶向连续性方面的缘起依赖性,众所周知;也加强子样峰处看到的那些。表明IDR加强融合体的遗传功用质组混合并且加强靶遗传功用质依赖性于。

为了次测试NUP98–HOXA9通过LLPS呈现出丝氨酸气化的战斗能力,研究者一个团队生成了传达N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞膜的Hi-C图谱,揭示了DNA气化和复制相互间的高度就其连续性。

为了确认N-IDRWT/A9对Hi-C接触频率的受到影响,他们有数了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9传达细胞膜里500个最排斥的N-IDRWT/A9占优势位点相互间的常与互依赖性计数。结果清高示,N-IDRWT/A9气化以基本上与CTCF也就是说的方法呈现出,与交叉驱动必要一致。另外,N-IDRWT/A9特异连续性气化重新通往加强子和靶遗传功用质相互间的通往,支持了融合mRNA突变的IDR通过交叉在;也加强子样靶点和癌遗传功用质相互间抑制DNA气化的观念。

综上所述,该研究者发掘出NUP98–HOXA9里包括的LLPS活连续性IDR对胃癌的频发和致癌遗传功用质传达程序的依赖性于至关重要。这些效应由IDR的战斗能力特异性:1)加强mRNA突变与遗传功用质组靶点的混合;2)有助于加强子和癌遗传功用质启动子相互间的长距离气化。

该研究者提供了一个致癌突变的原理连续性事实,该突变在转化处理过程里有助于LLPS驱动的mRNA突变混合和3D丝氨酸重组。由于含IDR的LLPS活连续性分子与广泛的胃癌有关,该研究者概述的必要也可以解释其他多种类型的胃癌。

原始典故:

Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.

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